上海综合保税区管理委员会作为上海市政府的派出机构，统一管理洋山保税港区、外高桥保税区（含外高桥保税物流园区）及浦东机场综合保税区的行政事务。上海综合保税区三区联动，实现了政策、资源、产业和功能的联动互补，集聚效应大大增强，凸显了三区作为海关特殊监管区域的整体优势。上海综合保税区将积极探索，锐意创新，建设具有自由贸易区功能的海关特殊监管区，使区域功能更丰富、成本更低廉、运作更顺畅、企业更便利，实现1+1+1>3的放大效应，形成资源优化整合、区域联动发展的新格局，成为上海建设国际航运中心的核心区域、国际贸易中心的重要载体、国际金融中心的重要突破点。